本课程是学校目前已开设的临床医学、口腔医学、预防医学等十余个专业和方向本科生（含7年制）的主要课程之一，但在法学、影像、心理、生物工程等专业中为基础医学一般课程。
病原微生物的新现与再现和全球城市化以及人口老龄化的进程，为传染病的流行创造了条件，控制传染病仍是21世纪医务工作者的重要任务。因此医学微生物学的课程目标是让学生掌握与人类疾病相关的病原微生物的基本特性、致病机制、机体的抗感染免疫、特异性诊断以及防治措施，而且是其他基础课程和临床课程的基础。